Она — дочь Филипа Р. Душку, албанско-американского администратора и преподавателя в Бостонских Общественных Школах, и бывшей его жены Джудит, университетский администратор и профессор в Суффолкском Университете, которая является датской американкой по линии обоих дедушек и англо-американкой по линии ее бабушек.
Элиза Душку снималась в клипе панк группы Simple Plan «I’m Just a Kid».
У нее есть три старших брата - Аарон, Бенджамин (родились 5 февраля 1976), и Натан (рожденный 8 июня 1977, в Бостоне, Штат Массачусетс), последний является моделью и актером.
Окончила Уотертаунскую Среднюю школу (штат Массачусетс).
Полное имя - Элиза Патриция Душку (Eliza Patricia Dushku).
Попала во внимание агентов по кастингу когда ей было всего 10 лет.