Её отец — актёр и режиссер документального кино Дик Кьюсак, актёрами стали также все её братья и сёстры. Мать Джоан – Нэнси - была учительницей математики, а также политической активисткой.
У неё есть два брата (Билл, Джон) и две сестры (Энн, Сьюзи).
Джоан Кьюсак - сестра Джона Кьюсака.
У Джоан Кьюсак есть два сына от брака с Ричардом Бёрком - Дилан Джон Бёрк (17.06.97) и Майлз Бёрк (род. в июле 2000).