Джонатан - двоюродный брат певца, композитора и актера Джеймса Уолперта.
У него есть старший брат Дэвид Грофф.
Джонатан родился в семье Джули и Джима Грофф, его мама - учитель физкультуры, отец - водитель и специалист по обучению лошадей.
Полное имя - Джонатан Дрю Грофф (Jonathan Drew Groff).
В 2005 году, благодаря своевременному диагностированию и хирургическому вмешательству, Джонатан смог победить обнаруженную у него на груди меланому (рак кожи).
В 2003 году Джонатан окончил общественную среднюю школу Conestoga Valley High School в Ланкастере (Пенсильвания), поступил в частный Университет Карнеги - Меллон в Питтсбурге (Пенсильвания), но из-за начавшейся театральной карьеры так и не приступил к учебе.