В 1988 году Алистэр окончил римско-католическую среднюю школу St John's Catholic School в Бишоп Окленде (Дарем) и в 1991 году - Колледж Гонвилл и Кай Кембриджского университета со степенью бакалавра гуманитарных наук в области английской литературы и английского языка, кроме английского он свободно владеет французским, немецким языками и бразильским вариантом португальского языка, неплохо знает польский язык, в 2013 году получил степень магистра в области психотерапии.
Учась в средней школе, Алистэр занимался регби и участвовал в театральных постановках, а учась в колледже, пел в церковном хоре, был членом команды по гребли и участвовал в театральных постановках.
Алистэр родился в семье Салли (Sally) и Питера Эпплтон (Peter Appleton), у него есть старший брат.
Учась в колледже, Алистер Эпплтон открыто объявил о своей гомосексуальной ориентации, хотя окончательно принял ее сам находясь в Германии.
После окончания колледжа Алистэр преподавал английский язык в 1992 году в Гданьском университете (Польша) и с 1993 по 1995 годы в Германии, с 1996 по 1999 годы был переводчиком, журналистом и телеведущим в немецкой медиакомпании «Deutsche Welle».