При работе над обликом Гидоры режиссёру и сценаристу Майклу Догерти хотелось создать что-то «уникальное», но что всё-таки напоминало бы Гидору. Именно поэтому он постоянно консультировался со специалистами киностудии «Toho», чтобы новый облик монстра оставался узнаваемым. Кроме того он изучал изображения различных рептилий, в особенности королевской кобры, чтобы добавить Гидоре реалистичности.
Найденный в начале фильма труп Годзиллы планировали обнаружить в Сибири, а не на Филиппинах, но эту задумку поменяли из-за аналогичной сцены в фантастического боевике Зака Снайдера «Человек из стали» (2013), где герой Генри Кавилла находит вмёрзший в лёд звездолёт с Криптона. Авторы этого фильма сцену переработали, и в Антарктике находят замороженного Кинг Гидору.
Крик Мотры в фильме – это обработанная версия криков этого же чудовища в оригинальных фильмах студии «Toho».
Возле подводного храма Годзиллы можно заметить скелет. Это скелет Ангируса, который в некоторых фильмах выступал на стороне Годзиллы.